En el ámbito de la Gestión Ambiental, SERNAGEOMIN desarrolla dos grandes líneas de trabajo, ambas dirigidas a minimizar los riesgos ambientales en el ámbito de la geología y la minería.

Desde el punto de vista de la geología, SERNAGEOMIN desarrolla estudios que integran las principales componentes geológicas que tienen impacto en el desarrollo y la calidad de vida de las comunidades. Estos trabajos han sido concebidos como herramientas para la planificación del uso del territorio y la gestión ambiental a escalas comunales y regionales.

Por el lado de la minería, coordina las materias medioambientales dentro de la gestión institucional, y a nivel regional, cuenta con profesionales encargados del tema en cada una de las oficinas regionales del Servicio.

A través de estas instancias SERNAGEOMIN cumple con las tareas de revisar, evaluar y fiscalizar proyectos en el marco del Sistema de Evaluación de Impacto Ambiental (SEIA); fiscalizar faenas mineras en operación; investigar y catastrar faenas mineras inactivas y gestionar proyectos de cooperación internacional para promover buenas prácticas ambientales en la actividad minera nacional.